合伙开店亏损应按约定或协商分担。依据《中华人民共和国民法典》，合伙亏损首先按合同约定处理，无约定则协商，协商不成按实缴出资比例分担，否则平均分担。不及时处理可能导致合伙人之间关系恶化，甚至引发法律纠纷。
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合伙开店亏损的常见处理方式为按约定分担或协商。首先查看合伙合同有无亏损分担约定，有则按约定执行；无则与合伙人协商，考虑出资比例、贡献度等因素确定分担方式。
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合伙亏损处理：1. 查合同，有约定按约定分担；2. 无约定则协商，考虑出资、贡献等因素；3. 协商不成，按实缴出资比例分担；4. 出资比例不明，则平均分担。及时沟通处理，避免纠纷。