申请法院院长再审需发现判决确有错误。依据《中华人民共和国民事诉讼法》第一百九十八条，院长对错误判决可提起再审，否则将维持原判，可能影响当事人权益。
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申请再审可这样操作：1. 若发现判决有误，先向原审法院院长提交再审申请，附上相关证据；2. 如院长未启动再审，可向上一级法院提交再审申请，并详细说明判决错误之处；3. 等待法院审查，如获准再审，则参与再审程序；4. 如未获准，可考虑其他法律途径。
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申请再审常见方式有向院长反映或向上一级法院申请。选择方式需视具体情况，如判决错误明显且院长易接触，则首选向院长反映；否则，向上一级法院申请更为稳妥。