绩效工资扣款因业绩不达标不合法。依据《劳动法》，绩效工资是考核后分配的工资，不应与基本工资挂钩，随意扣款可能侵犯员工权益。若不及时处理，可能导致员工工作积极性下降，甚至引发劳动纠纷。
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绩效扣款可协商处理。具体操作：1. 与用人单位明确扣款原因，要求提供扣款依据；2. 若扣款不合理，提出异议并协商解决方案；3. 协商不成，收集证据向劳动监察部门投诉；4. 必要时，申请劳动仲裁，由仲裁机构裁决。
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对绩效扣款问题，常见处理方式有协商、投诉或仲裁。首先应与用人单位沟通协商；若协商无果，可向劳动监察部门投诉；仍无法解决时，可申请劳动仲裁，根据《劳动法》维护自身权益。